Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWF1Q12792 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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