Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXO1Q12778 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms