Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms