Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms