Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP3CAQ08209 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms