Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABPB1Q06547 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms