Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms