Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN12Q05209 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms