Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ERCC6Q03468 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ERCC6Q03468 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms