Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ID3Q02535 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ID3Q02535 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ID3Q02535 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ID3Q02535 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ID3Q02535 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ID3Q02535 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ID3Q02535 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ID3Q02535 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ID3Q02535 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ID3Q02535 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ID3Q02535 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ID3Q02535 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ID3Q02535 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms