Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OC90Q02509 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OC90Q02509 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OC90Q02509 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
OC90Q02509 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
OC90Q02509 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OC90Q02509 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms