Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FLI1Q01543 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms