Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms