Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VLDLRP98155 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms