Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HTD2P86397 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HTD2P86397 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HTD2P86397 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HTD2P86397 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HTD2P86397 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HTD2P86397 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTD2P86397 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTD2P86397 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTD2P86397 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTD2P86397 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTD2P86397 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTD2P86397 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTD2P86397 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTD2P86397 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTD2P86397 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTD2P86397 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTD2P86397 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTD2P86397 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTD2P86397 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTD2P86397 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTD2P86397 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTD2P86397 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTD2P86397 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms