Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms