Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX5P78411 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX5P78411 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX5P78411 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX5P78411 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX5P78411 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX5P78411 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX5P78411 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX5P78411 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX5P78411 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX5P78411 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX5P78411 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX5P78411 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX5P78411 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX5P78411 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX5P78411 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX5P78411 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX5P78411 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX5P78411 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX5P78411 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX5P78411 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms