Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP1P63208 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP1P63208 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP1P63208 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms