Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms