Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2HP62256 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2HP62256 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms