Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCS1P62166 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCS1P62166 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCS1P62166 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCS1P62166 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCS1P62166 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCS1P62166 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCS1P62166 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms