Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-16P61578 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-16P61578 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-16P61578 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-16P61578 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-16P61578 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms