Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2FP61218 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2FP61218 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms