Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN1P60606 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms