Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVPABLB-1P60509 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms