Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms