Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms