Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR4P51679 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCR4P51679 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCR4P51679 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCR4P51679 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCR4P51679 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms