Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAMP50895 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAMP50895 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAMP50895 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BCAMP50895 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BCAMP50895 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BCAMP50895 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BCAMP50895 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BCAMP50895 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAMP50895 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAMP50895 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAMP50895 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAMP50895 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAMP50895 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAMP50895 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAMP50895 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms