Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNTAP49354 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNTAP49354 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNTAP49354 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNTAP49354 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FNTAP49354 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNTAP49354 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNTAP49354 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FNTAP49354 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNTAP49354 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FNTAP49354 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FNTAP49354 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FNTAP49354 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FNTAP49354 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FNTAP49354 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FNTAP49354 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms