Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC9A3P48764 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms