Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CPA2P48052 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CPA2P48052 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CPA2P48052 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CPA2P48052 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CPA2P48052 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CPA2P48052 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CPA2P48052 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CPA2P48052 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CPA2P48052 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CPA2P48052 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CPA2P48052 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CPA2P48052 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CPA2P48052 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CPA2P48052 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CPA2P48052 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CPA2P48052 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CPA2P48052 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CPA2P48052 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CPA2P48052 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CPA2P48052 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms