Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2IP36954 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms