Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP214P35658 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP214P35658 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms