Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD13P35453 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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