Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NF2P35240 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NF2P35240 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NF2P35240 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NF2P35240 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NF2P35240 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NF2P35240 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NF2P35240 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF2P35240 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NF2P35240 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF2P35240 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NF2P35240 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NF2P35240 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NF2P35240 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NF2P35240 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NF2P35240 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NF2P35240 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NF2P35240 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NF2P35240 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms