Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPC1P35052 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC1P35052 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC1P35052 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC1P35052 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC1P35052 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms