Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPS1P31327 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CPS1P31327 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPS1P31327 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPS1P31327 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPS1P31327 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPS1P31327 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPS1P31327 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CPS1P31327 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPS1P31327 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CPS1P31327 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms