Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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