Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms