Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLNP26678 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLNP26678 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLNP26678 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms