Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTX3P26022 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTX3P26022 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTX3P26022 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTX3P26022 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTX3P26022 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTX3P26022 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTX3P26022 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms