Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms