Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms