Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD53P19397 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD53P19397 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD53P19397 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD53P19397 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD53P19397 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD53P19397 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD53P19397 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD53P19397 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD53P19397 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD53P19397 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms