Protein–RNA interactions for Protein: P18827

SDC1, Syndecan-1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC1P18827 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDC1P18827 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDC1P18827 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDC1P18827 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDC1P18827 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDC1P18827 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDC1P18827 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SDC1P18827 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDC1P18827 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDC1P18827 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDC1P18827 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDC1P18827 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDC1P18827 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms