Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR1P18146 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms