Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DESP17661 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DESP17661 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DESP17661 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DESP17661 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DESP17661 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms