Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CPEP16870 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CPEP16870 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CPEP16870 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CPEP16870 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms