Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAV1P15498 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAV1P15498 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAV1P15498 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAV1P15498 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAV1P15498 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms